陈晓亚（1955.08-  ），出生于江苏扬州。植物生理学家，主要从事植物生理和分子生物学研究。

1982年毕业于南京大学生物学系。1985年获英国里丁大学博士学位。同年回国任教于南京大学生物系，先后担任讲师，副教授。1992年前往美国普渡大学从事博士后研究。1994年起进入中国科学院上海植物生理研究所工作。2005年当选为中国科学院院士。